Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D1K7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D1K7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D1K7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1K7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D1K7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D1K7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1K7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1K7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1K7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms