Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl53Q9D1H8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl53Q9D1H8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.2 ms