Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lysmd1Q9D0E3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lysmd1Q9D0E3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lysmd1Q9D0E3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lysmd1Q9D0E3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lysmd1Q9D0E3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms