Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdhd3Q9CYW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdhd3Q9CYW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms