Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc8Q9CYA6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zcchc8Q9CYA6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms