Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sft2d3Q9CSV6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sft2d3Q9CSV6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sft2d3Q9CSV6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms