Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snw1Q9CSN1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snw1Q9CSN1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms