Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Gdpd1Q9CRY7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Gdpd1Q9CRY7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Gdpd1Q9CRY7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdpd1Q9CRY7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Gdpd1Q9CRY7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gdpd1Q9CRY7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gdpd1Q9CRY7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Gdpd1Q9CRY7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd1Q9CRY7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdpd1Q9CRY7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdpd1Q9CRY7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdpd1Q9CRY7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdpd1Q9CRY7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms