Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Use1Q9CQ56 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Use1Q9CQ56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Use1Q9CQ56 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Use1Q9CQ56 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Use1Q9CQ56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Use1Q9CQ56 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Use1Q9CQ56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Use1Q9CQ56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Use1Q9CQ56 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Use1Q9CQ56 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Use1Q9CQ56 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Use1Q9CQ56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Use1Q9CQ56 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Use1Q9CQ56 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Use1Q9CQ56 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Use1Q9CQ56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Use1Q9CQ56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Use1Q9CQ56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Use1Q9CQ56 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Use1Q9CQ56 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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