Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska1Q9CPV1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ska1Q9CPV1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ska1Q9CPV1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska1Q9CPV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska1Q9CPV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska1Q9CPV1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska1Q9CPV1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms