Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim8Q99PJ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim8Q99PJ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim8Q99PJ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim8Q99PJ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim8Q99PJ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms