Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsnaxip1Q99P25 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsnaxip1Q99P25 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsnaxip1Q99P25 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsnaxip1Q99P25 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsnaxip1Q99P25 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsnaxip1Q99P25 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms