Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brms1Q99N20 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brms1Q99N20 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brms1Q99N20 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brms1Q99N20 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.2 ms