Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtpbp4Q99ME9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtpbp4Q99ME9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtpbp4Q99ME9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms