Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmed9Q99KF1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed9Q99KF1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed9Q99KF1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmed9Q99KF1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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