Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf144aQ925F3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf144aQ925F3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms