Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcaf2Q921K8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcaf2Q921K8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf2Q921K8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf2Q921K8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf2Q921K8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf2Q921K8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf2Q921K8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf2Q921K8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms