Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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