Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps3Q91VB4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps3Q91VB4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps3Q91VB4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms