Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SelenomQ8VHC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SelenomQ8VHC3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SelenomQ8VHC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms