Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE4

Rpa1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa1Q8VEE4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa1Q8VEE4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa1Q8VEE4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpa1Q8VEE4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpa1Q8VEE4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpa1Q8VEE4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpa1Q8VEE4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpa1Q8VEE4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa1Q8VEE4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa1Q8VEE4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa1Q8VEE4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa1Q8VEE4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms