Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med17Q8VCD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Med17Q8VCD5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Med17Q8VCD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Med17Q8VCD5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med17Q8VCD5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med17Q8VCD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med17Q8VCD5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med17Q8VCD5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.1 ms