Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc137Q8R0K4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc137Q8R0K4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc137Q8R0K4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc137Q8R0K4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms