Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpt1Q8K1R3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pnpt1Q8K1R3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnpt1Q8K1R3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms