Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc4a8Q8JZR6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc4a8Q8JZR6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc4a8Q8JZR6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms