Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4932414N04RikQ8CEQ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4932414N04RikQ8CEQ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4932414N04RikQ8CEQ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4932414N04RikQ8CEQ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4932414N04RikQ8CEQ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4932414N04RikQ8CEQ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4932414N04RikQ8CEQ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4932414N04RikQ8CEQ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms