Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc28bQ8CEG5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc28bQ8CEG5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms