Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228aQ8CDW1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam228aQ8CDW1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam228aQ8CDW1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms