Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrif1Q8CDD9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrif1Q8CDD9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 492.4 ms