Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CntrobQ8CB62 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CntrobQ8CB62 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CntrobQ8CB62 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms