Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9bQ8C7I4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apol9bQ8C7I4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol9bQ8C7I4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apol9bQ8C7I4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms