Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc90bQ8C3X2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms