Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8C1R3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8C1R3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8C1R3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8C1R3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8C1R3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8C1R3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8C1R3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Q8C1R3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8C1R3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C1R3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms