Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV66

Ifi44, Interferon-induced protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44Q8BV66 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi44Q8BV66 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi44Q8BV66 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi44Q8BV66 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi44Q8BV66 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi44Q8BV66 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi44Q8BV66 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi44Q8BV66 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi44Q8BV66 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifi44Q8BV66 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi44Q8BV66 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi44Q8BV66 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms