Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp4aQ8BU40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4aQ8BU40 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4aQ8BU40 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms