Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc17a6Q8BLE7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc17a6Q8BLE7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc17a6Q8BLE7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc17a6Q8BLE7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc17a6Q8BLE7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc17a6Q8BLE7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a6Q8BLE7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc17a6Q8BLE7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc17a6Q8BLE7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.2 ms