Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
6820408C15RikQ8BJX2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
6820408C15RikQ8BJX2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
6820408C15RikQ8BJX2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms