Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8BGC1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8BGC1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8BGC1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8BGC1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8BGC1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8BGC1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8BGC1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8BGC1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms