Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhot1Q8BG51 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rhot1Q8BG51 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhot1Q8BG51 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms