Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc50Q810U5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc50Q810U5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms