Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmc3Q7TQ69 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmc3Q7TQ69 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmc3Q7TQ69 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmc3Q7TQ69 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmc3Q7TQ69 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmc3Q7TQ69 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmc3Q7TQ69 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmc3Q7TQ69 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmc3Q7TQ69 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmc3Q7TQ69 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmc3Q7TQ69 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmc3Q7TQ69 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms