Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim17Q7TPM3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim17Q7TPM3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms