Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TwistnbQ78WZ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwistnbQ78WZ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.9 ms