Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc44a1Q6X893 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc44a1Q6X893 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc44a1Q6X893 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc44a1Q6X893 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc44a1Q6X893 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms