Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2eQ6VUP9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms