Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Flrt1Q6RKD8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Flrt1Q6RKD8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Flrt1Q6RKD8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Flrt1Q6RKD8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Flrt1Q6RKD8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Flrt1Q6RKD8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Flrt1Q6RKD8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Flrt1Q6RKD8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Flrt1Q6RKD8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Flrt1Q6RKD8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Flrt1Q6RKD8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Flrt1Q6RKD8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms