Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neil2Q6R2P8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neil2Q6R2P8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neil2Q6R2P8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms