Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Atp1a3Q6PIC6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a3Q6PIC6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1a3Q6PIC6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1a3Q6PIC6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1a3Q6PIC6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1a3Q6PIC6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1a3Q6PIC6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1a3Q6PIC6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1a3Q6PIC6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1a3Q6PIC6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1a3Q6PIC6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1a3Q6PIC6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms