Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc82Q6PG04 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc82Q6PG04 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc82Q6PG04 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms