Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf4Q6PFF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf4Q6PFF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf4Q6PFF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.2 ms